Nació en Itauguá el martes 16 de octubre de 1883, hijo de Rafael Filártiga Toca y Maza y de Petrona Cardozo. Maestro de escuela, agrimensor y líder campesino, recorría toda la comarca a caballo y llegó a ser presidente de la Cámara de Representantes.
Pastor Calixto contrajo matrimonio con Élida del Carmen Candia, nacida en Itauguá el jueves 16 de julio de 1891, hija de Fernanda Candia. Élida del Carmen fue su alumna, a quien “raptó” (okañy oñondivé), conforme a las costumbres de la época, cuando él tenía 22 años de edad.
De la unión de Pastor Calixto y Élida del Carmen nacieron Elvira (murió al nacer) y Margarita (no nació). Los siguientes nacieron en Itá: Lidia Margarita (1912), Carlos Aníbal (1914), César Augusto (1916), Vicente Eladio (1918), Pastor (1920), Sara (1922, murió de viruela negra el año de nacer), Fernando Arturo (1924), Raúl Alberto (1926) y Óscar Roberto (1928).
Prisionero en el Chaco, fugado de Emboscada
En julio de 1908, los liberales radicales liderados por Albino Jara ejecutan un golpe de Estado y desplazan a los cívicos: González Navero reemplaza a Ferreira. Cívicos y colorados son apresados, torturados, exiliados algunos, otros enviados a un campo de prisioneros en el Chaco.
Filártiga llegó a Bahía Negra el día que cumplió 25 años; de ahí fue trasladado con los demás al campo de prisioneros de Fortín Galpón. Allí, además del trabajo duro, el capitán Salinas le hizo formar una banda para divertirle. En la banda, Filártiga tocaba el violín; los otros eran Ojeda Fariña y Cortázar. Luego los trasladaron a Emboscada, de donde se escaparon.
En 1909 se plegó a un golpe colorado en Ñeembucú. Los liberales gubernistas ganaron y él huyó a Corrientes. Allí fue cajero en una casa comercial durante alrededor de un año. Fue perseguido político permanentemente; trataron de matarlo un par de veces.
Entre tanto, Élida quedó en Itauguá. Un tiempo después de volver Filártiga, se mudaron a Itá y trabajó de agrimensor. En 1920, su esposa y él compraron la casa de Itá. En 1927 se casaron: la ceremonia religiosa se realizó en la sala de la casa.
La banda presidencial y la desilusión
Fue él quien le impuso la banda presidencial al general Alfredo Stroessner Matiauda. Con el tiempo, Pastor Filártiga estuvo disconforme con haberse encargado de la misión referida. En el momento que le impuso la banda terminó la anarquía, pero después vendrían las desilusiones contra Stroessner de no pocos dirigentes colorados.
Descendientes consultados afirman que al final de su vida le caían lágrimas por la desilusión que le provocó Stroessner, lamentándose sentado en su viejo sillón a la sombra de un yvapovõ.
Filártiga se negaba a usar el auto VW que le facilitó la Cámara con servicio de chofer. Venía al Parlamento en ómnibus desde Itá cuando la ruta era de tierra, de puro barro por Posta Gaona.
En la Junta de Gobierno y en la Cámara
Fue miembro titular de la Junta de Gobierno del Partido Colorado cuando asumió Stroessner a la presidencia de la República. Entonces la presidencia de la ANR estuvo a cargo de Tomás Romero Pereira.
Ocupó el cargo de vicepresidente de la Junta e interinó la presidencia. Presidió la histórica sesión del 27 de octubre de 1955, oportunidad en que se concretó la unidad partidaria. Igualmente presidió la convención extraordinaria de la ANR, realizada el 19 de septiembre de 1959.
Contaba con una sólida formación intelectual, se ceñía a los conceptos morales de la época, era un señor a quien consultaban sus correligionarios y no correligionarios. Sus opiniones, observaciones y recomendaciones eran respetadas.
Ocupó el cargo de presidente de la Cámara de Representantes entre mayo de 1954 y octubre de 1955 (quizá hasta 1958, cuando asumió el nuevo congreso presidido por J. Eulogio Estigarribia). En ese tiempo se sanciona la ley 294 “De defensa de la democracia”.
En mayo de 1957 firmó, junto a otros dirigentes partidarios, el Acta de Cerro León, impulsando la reelección de Stroessner. En febrero de 1958 hubo elecciones presidenciales y parlamentarias, con lista única de candidatos: Filártiga fue candidato número 11 en la lista de titulares.
En junio de 1959 estuvo del lado de Stroessner en la disolución del Congreso y la persecución de correligionarios. En 1963 hubo dos listas y él fue candidato número 5 en la lista de titulares. En 1968 ya no figuró en las listas de senadores y diputados. Tampoco fue convencional en 1967.
En varios libros su nombre es destacado. Falleció en Itá el miércoles 18 de junio de 1969, a los 86 años de edad, de un infarto. Una calle asuncena lleva su nombre.